目前提供的信息中并没有具体提到在甘肃永靖县哪个特定地点进行了3D-VR高清视频的拍摄。不过，根据已知的资料：

航拍甘肃永靖县的城市景观，显示城市虽小但高楼很多。

航拍了刘家峡，环境优美，被称为兰州人民的后花园。

郁金香公园和红土崖也被航拍，并提到了艺术元素。

甘肃省临夏州的“花儿”故乡：甘肃永靖县有音乐相关的vlog视频。

记录了甘肃永靖省道S230沿途的家乡风景。

如果要拍摄3D-VR高清视频，以下地点可能具有拍摄价值：

城市中心的高楼区域，可以展示城市的立体风貌。

刘家峡风景区，因其优美的自然环境和可能的户外活动。

郁金香公园和红土崖，特别是红土崖上的艺术元素可能适合3D-VR呈现。

如果“花儿”表演有合适的场地或者文化活动，也可以考虑进行3D-VR录制，以提供沉浸式的音乐体验。

沿着省道S230的风景线路，可以拍摄沿途的自然风光和人文景观。

为了获得确切的3D-VR高清视频拍摄地点，建议查询最新的视频制作项目或者联系当地的专业制作团队，他们可能会有关于最适合拍摄此类视频的具体地点的信息。