团关系转到学院总支部后，是否会被分配到班级支部，这主要取决于学校的团组织管理模式和规定。

一般来说，学院总支部是学院层面的共青团组织，负责统筹和管理该学院的所有团组织活动。而班级支部则是最基层的团组织，直接负责班级内的团务工作。

在一些学校，团关系转入学院总支部后，会根据学生的班级归属进一步分配到对应的班级支部。这样可以更好地组织和开展贴近班级实际的团活动，同时也能确保每个团员都能参与到团组织生活之中。

但在其他学校，团关系可能一直保留在学院总支部，由总支部直接管理各个团员的团务工作，班级支部的作用可能会相对较小。

因此，具体是否会分配到班级支部，还需要参照你所在学校的具体团组织管理模式和规定。建议你可以向学院的团组织负责人或者辅导员咨询，了解详细的流程和规定。