1995年至2000年间，河南和湖南的农业碳排放上升可能由以下几个因素导致：

农业生产扩张：随着人口增长和对粮食需求的增加，农业生产规模可能会扩大。这包括耕地面积的增加、农作物种植面积的扩大以及畜牧业的发展。这些活动都会导致碳排放的增加，因为农业生产过程中会释放二氧化碳和其他温室气体，如氮氧化物和甲烷。

农业投入增加：为了提高农业生产效率和产量，可能会增加化肥、农药和能源的使用。化肥生产和使用过程中会产生大量的氮氧化物，而农药和能源消耗则会间接导致碳排放的增加。

畜牧业发展：畜牧业是农业碳排放的重要来源，特别是大规模集约化养殖。动物消化过程产生的甲烷排放以及粪便管理不当导致的氮氧化物和甲烷排放都会增加农业碳排放。

土壤管理实践：不恰当的土壤管理实践，如过度耕作和不合理灌溉，可能导致土壤有机碳的损失，从而增加碳排放。

技术和设备落后：在这一时期，如果农业技术和设备较为落后，能效较低，那么在进行农田作业、灌溉、收获和加工等活动时，能源消耗和碳排放可能会较高。

政策和市场因素：政府的农业政策、补贴措施以及市场价格变化也可能影响农业生产的规模和方式，从而影响碳排放。例如，对某些高碳排放农产品的补贴可能会刺激其生产，进而增加碳排放。

需要注意的是，这些因素通常是相互关联和交织的，且具体原因需要根据当时两地的具体农业政策、经济发展水平、气候条件和农业实践等因素进行详细分析。由于我提供的信息截止到2023年，对于1995年至2000年间河南和湖南农业碳排放的具体原因，可能需要查阅该时期的相关研究报告或统计数据以获取更准确的答案。